Desde 2020 la superficie de cultivos ecológicos está aumentando debido a las directrices del Pacto Verde Europeo que pretende que al menos el 25% de cada cultivo sea en ecológico. En 2022 la superficie de almendro ecológico en España es de unas 166.000 hectáreas y su producción tiene un avalor añadido de 3 a 4 €/kg más que la almendra convencional.

El objetivo agronómico de la producción ecológica es mantener e incrementar la fertilidad del suelo a medio y largo plazo, promocionando las cubiertas vegetales, el compostaje de residuos en la propia finca, la incorporación de restos de poda triturados y la aplicación de estiércol, para velar por la actividad biológica del suelo que limite la presencia y desarrollo de organismos perjudiciales y un mejor control natural de las plagas.